Manchas histológicas podem identificar mudanças morfológicas e moleculares em tecidos, estando ligadas a doenças e envelhecimento. Combinações diferentes de manchas visam tecidos e tipos de células diferentes.

Com a mancha mais comum, hematoxilina/eosina (H&E), a hematoxilina mancha o núcleo da célula de azul, e a eosina mancha o citoplasma de rosa e componentes estromais em vários graus de vermelho/rosa. Portanto, a mancha revela muitas informações estruturais, com implicações funcionais específicas.